醫療污水的不正確排放對環境資源會造成較大的危害，而真正能夠達到國家排放標準的又很少。目前，環保意識的薄弱及處理方法的不正確造成了醫療直排、各大醫院和疾控中心存在的“高污染，低治理”現狀。
根據相關資料，與工業廢水相比，醫療廢水對環境的影響更大，危害也更大。醫院在運行過程中，不可避免地產生了具有直接或者間接感染性、毒性以及其他危害性的廢水，這些廢水的來源決定了其成分復雜性，涉及多種生物性、化學性或放射性污染。
1.醫院、衛生院、醫療機構需要執行《醫療機構水污染排放標準》GB18466-2005中的標準。
2.醫療機構污水處理的程度，主要是根據污水的排向而定，本著安全、環保、節能、減排、增效的基本原則，選擇技術前瞻、工藝可靠、工程投資經濟、處理效果穩定、處理流程簡化、運轉費用經濟、操作管理簡單的污水處理工藝。
3.綜合醫療機構(縣級或20張床位以下和其他所有醫療)機構，無論排放到何處，較低要求必須經消毒處理后方可排放?？梢圆捎玫难b置有虹吸式二氧化氯消毒裝置以及自動同步雙虹吸醫院污水消毒裝置。
疾控中心污水處理設備處理后污水可達以下排放依據：
《污水綜合排放》GB8978-1996。
《城鎮污水處理廠污染物排放》GB18918-2002。
《機構水污染物排放》GB18466-2005。
《污水城市下水道水質》 GB/T 31962-2015。
